Биоинформатики СПбГУ разработали сборщик для расшифровки геномов коронавируса — coronaSPAdes, передаёт пресс-служба университета.
С его помощью можно изучать геномы живых организмов, в том числе вирусов. К слову, до этого учёным приходилось исследовать отдельные фрагменты, которые позже складывались в пазл, состоящий из миллионов частей.
— Эта задача относится к одной из самых сложных алгоритмических проблем в биоинформатике, и, чтобы её решить, необходимо использовать специальные инструменты — геномные сборщики, — отметила пресс-служба.
На данный момент разработка биоинформатиков даёт возможность восстанавливать геномы коронавирусов de novo в разы эффективнее и качественнее, чем это делалось ранее.
Напомним, в марте 2020 года научные сотрудники Центра алгоритмической биотехнологии СПбГУ Дмитрий Антипов и Михаил Райко помогли Институту гриппа им. Смородинцева собрать геном российского варианта COVID-19.